南京南到潍坊市的列车车次信息显示，下午时段有多趟列车可供选择。具体车次如下：

1. D5538次：南京南14:22发车，17:37到达潍坊市。

2. D5540次：南京南14:30发车，17:45到达潍坊市。

3. D5542次：南京南14:40发车，17:55到达潍坊市。

以上信息仅供参考，具体以火车站当日实际售票情况为准。建议出行前再次确认车次信息及到达时间。