南京到南通的动车行程中，沿途会经过多个站点。具体站点数量可能会根据列车的具体线路和停靠站设置有所不同，但通常情况下，从南京南站出发至南通站，动车会经过大约7到8个站点。这些站点包括但不限于南京南、句容北、常州北、丹阳、镇江、扬州东和泰州等。具体的停靠站点以及数量可能会有所变动，建议出行前通过铁路******网站或相关APP查询最新的列车时刻表和停靠信息，以确保行程顺利。