病假工资的计算往往涉及到企业内部的规章******以及国家劳动******法规。在处理病假工资时，是否扣除双休日的工资，需要根据具体情况和公司政策来决定。一般来说，病假期间的工资计算方式多样，有的公司可能会扣除员工在病假期间的双休日工资，而有的则不会扣除。

首先，根据《中华人民共和国*********》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，******不低于工资的百分之二百的工资报酬。因此，在正常工作日之外的工作时间（包括法定节假日和周末），如果员工被要求工作，则应获得相应的加班费或补休。然而，在病假期间，并不适用这一规定。

其次，关于是否扣除双休日的病假工资，这通常取决于公司的具体政策。一些公司可能会认为员工在病假期间应享受完整的薪酬待遇，包括双休日；而另一些公司则可能认为员工在病假期间不应享受双休日的薪酬待遇。因此，在这种情况下，员工应当查阅其所在公司的具体规定或咨询人力资源部门以了解详细情况。

此外，在实际操作中，企业也应当遵循公平、合理的原则处理此类问题。如果企业决定扣除员工在病假期间的双休日工资，则应当确保这一做法符合相关******法规的要求，并且事先告知员工相关政策。

总之，在处理病假工资时是否扣除双休日的问题上，企业和员工都应保持沟通和理解。企业应明确其政策并告知所有员工；而员工也应了解自身权益并及时与雇主沟通解决任何疑问或争议。