公司以不能胜任工作辞退员工时，需要遵循一定的程序和******规定，以确保合法合规，并合理赔偿员工损失。首先，公司在辞退员工前，应当进行绩效评估和培训辅导，确认员工确实无法胜任当前岗位工作。其次，公司需向员工发出书面通知，明确告知辞退原因及依据，并给予一定期限内改进的机会。

根据《中华人民共和国劳动******法》第四十条的规定，公司因员工不能胜任工作而辞退员工时，应当提前30日以书面形式通知劳动者本人或额外******一个月工资。此外，公司还应******相应的经济补偿金。经济补偿金的计算标准为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年******一个月工资的标准向劳动者******。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者******半个月工资的经济补偿。

在实际操作中，公司应详细记录员工的工作表现、培训情况以及改进机会等信息，并妥善保存相关证据。同时，在辞退过程中与员工进行充分沟通，尽量达成一致意见。若双方就补偿金额或其他事宜产生争议，则可通过协商解决或申请劳动仲裁。

总之，在以不能胜任工作为由辞退员工时，公司必须严格遵守******法规要求，并给予适当补偿。这不仅有助于维护企业的合法利益，也有利于构建和谐稳定的劳动关系。