大部分施工索赔采用的计算方法主要包括直接费用法、总费用法、修正的总费用法以及比例分析法。这些方法各有特点，适用于不同的索赔情况。

直接费用法是最常见的一种计算方法。这种方法主要针对因承包商自身原因导致的工期延误或工程变更所引发的索赔。直接费用包括额外增加的人工费、材料费、机械使用费等，通过实际发生的额外成本进行计算。这种方法简单明了，但需要详细记录和准确统计所有额外支出。

总费用法适用于工期延误引起的索赔，尤其是当工程变更导致整个项目成本上升时。这种方法不仅考虑直接成本，还包括间接成本如管理费、总部管理费等。在计算时，首先确定索赔事件发生前后的总成本差异，然后从中扣除正常的预期利润和其他非因该事件而产生的额外支出。

修正的总费用法是对总费用法的一种改进，适用于工程变更较大且难以准确预估原******价格的情况。该方法首先确定索赔事件发生前的合理成本（即基准值），然后根据实际发生的工程量和市场价格重新评估整个项目的成本，并从中扣除合理的预期利润和其他非因该事件而产生的额外支出。

比例分析法则适用于工期延误导致的成本增加情况。这种方法基于原******总价与实际完成工作量的比例关系来估算因延误而增加的成本。具体做法是将原******总价按照已完成工作的比例分配到剩余未完成的工作中，然后计算出由于延误导致的成本增加部分。

在实际应用中，选择哪种方法取决于具体的索赔情况和双方协商的结果。每种方法都有其适用范围和局限性，在使用时需要结合实际情况灵活运用，并确保******的真实性和准确性以支持索赔请求的有效性。